1. RODNA
  2. CONICET
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Campo DC Valor Lengua/Idioma
dc.creatorMacchiaroli, Natalia-
dc.creatorMaldonado, Lucas Luciano-
dc.creatorZarowiecki, Magdalena-
dc.creatorCucher, Marcela Alejandra-
dc.creatorGismondi, Maria Ines-
dc.creatorKamenetzky, Laura-
dc.creatorRosenzvit, Mara Cecilia-
dc.date2018-04-05T19:48:27Z-
dc.date2018-04-05T19:48:27Z-
dc.date2017-04-
dc.date2018-04-05T13:42:57Z-
dc.date.accessioned2019-04-29T15:28:35Z-
dc.date.available2019-04-29T15:28:35Z-
dc.date.issued2018-04-05T19:48:27Z-
dc.date.issued2018-04-05T19:48:27Z-
dc.date.issued2017-04-
dc.date.issued2018-04-05T13:42:57Z-
dc.identifierMacchiaroli, Natalia; Maldonado, Lucas Luciano; Zarowiecki, Magdalena; Cucher, Marcela Alejandra; Gismondi, Maria Ines; et al.; Genome-wide identification of microRNA targets in the neglected disease pathogens of the genus Echinococcus; Elsevier Science; Molecular and Biochemical Parasitology; 214; 4-2017; 91-100-
dc.identifier0166-6851-
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11336/40977-
dc.identifierCONICET Digital-
dc.identifierCONICET-
dc.identifier.urihttp://rodna.bn.gov.ar:8080/jspui/handle/bnmm/294803-
dc.descriptionMicroRNAs (miRNAs), a class of small non-coding RNAs, are key regulators of gene expression at post-transcriptional level and play essential roles in biological processes such as development. MiRNAs silence target mRNAs by binding to complementary sequences in the 3´untranslated regions (3´UTRs). The parasitic helminths of the genus Echinococcus are the causative agents of echinococcosis, a zoonotic neglected disease. In previous work, we performed a comprehensive identification and characterization of Echinococcus miRNAs. However, current knowledge about their targets is limited. Since target prediction algorithms rely on complementarity between 3´UTRs and miRNA sequences, a major limitation is the lack of accurate sequence information of 3´UTR for most species including parasitic helminths. We performed RNA-seq and developed a pipeline that integrates the transcriptomic data with available genomic data of this parasite in order to identify 3´UTRs of E. canadensis. The high confidence set of 3´UTRs obtained allowed the prediction of miRNA targets in Echinococcus through a bioinformatic approach. We performed for the first time a comparative analysis of miRNA targets in Echinococcus and Taenia. We found that many evolutionarily conserved target sites in Echinococcus and Taenia may be functional and under selective pressure. Signaling pathways such as MAPK and Wnt were among the most represented pathways indicating miRNA roles in parasite growth and development. Genome-wide identification and characterization of miRNA target genes in Echinococcus provide valuable information to guide experimental studies in order to understand miRNA functions in the parasites biology. miRNAs involved in essential functions, especially those being absent in the host or showing sequence divergence with respect to host orthologs, might be considered as novel therapeutic targets for echinococcosis control.-
dc.descriptionFil: Macchiaroli, Natalia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina-
dc.descriptionFil: Maldonado, Lucas Luciano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina-
dc.descriptionFil: Zarowiecki, Magdalena. Parasite Genomics Group; Reino Unido-
dc.descriptionFil: Cucher, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina-
dc.descriptionFil: Gismondi, Maria Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas; Argentina-
dc.descriptionFil: Kamenetzky, Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina-
dc.descriptionFil: Rosenzvit, Mara Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina-
dc.formatapplication/pdf-
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dc.languageeng-
dc.publisherElsevier Science-
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.molbiopara.2017.04.001-
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166685117300488-
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/restrictedAccess-
dc.rightshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/-
dc.sourcereponame:CONICET Digital (CONICET)-
dc.sourceinstname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas-
dc.sourceinstacron:CONICET-
dc.subjectMICRORNA-
dc.subjectTARGETS-
dc.subjectBIOINFORMATICS-
dc.subjectECHINOCOCCOSIS-
dc.subjectOtras Ciencias Biológicas-
dc.subjectCiencias Biológicas-
dc.subjectCIENCIAS NATURALES Y EXACTAS-
dc.titleGenome-wide identification of microRNA targets in the neglected disease pathogens of the genus Echinococcus-
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article-
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion-
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/articulo-
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