Registro completo de metadatos
Campo DC Valor Lengua/Idioma
dc.creatorSimonetti, Franco Lucio-
dc.creatorTeppa, Elin-
dc.creatorChernomoretz, Ariel-
dc.creatorNielsen, Morten-
dc.creatorMarino Buslje, Cristina-
dc.date2015-12-21T17:55:03Z-
dc.date2015-12-21T17:55:03Z-
dc.date2013-05-
dc.date2016-03-30 10:35:44.97925-03-
dc.date.accessioned2019-04-29T15:29:19Z-
dc.date.available2019-04-29T15:29:19Z-
dc.date.issued2015-12-21T17:55:03Z-
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dc.date.issued2013-05-
dc.date.issued2016-03-30 10:35:44.97925-03-
dc.identifierSimonetti, Franco Lucio; Teppa, Elin; Chernomoretz, Ariel; Nielsen, Morten; Marino Buslje, Cristina ; MISTIC: mutual information server to infer coevolution; Oxford University Press; Nucleic Acids Research; 41; W1; 5-2013; W8-W14-
dc.identifier0305-1048-
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11336/3114-
dc.identifier1362-4962-
dc.identifier.urihttp://rodna.bn.gov.ar:8080/jspui/handle/bnmm/295063-
dc.descriptionMISTIC (mutual information server to infer coevolution) is a web server for graphical representation of the information contained within a MSA (multiple sequence alignment) and a complete analysis tool for Mutual Information networks in protein families. The server outputs a graphical visualization of several information-related quantities using a circos representation. This provides an integrated view of the MSA in terms of (i) the mutual information (MI) between residue pairs, (ii) sequence conservation and (iii) the residue cumulative and proximity MI scores. Further, an interactive interface to explore and characterize the MI network is provided. Several tools are offered for selecting subsets of nodes from the network for visualization. Node coloring can be set to match different attributes, such as conservation, cumulative MI, proximity MI and secondary structure. Finally, a zip file containing all results can be downloaded. The server is available at http://mistic.leloir.org.ar. In summary, MISTIC allows for a comprehensive, compact, visually rich view of the information contained within an MSA in a manner unique to any other publicly available web server. In particular, the use of circos representation of MI networks and the visualization of the cumulative MI and proximity MI concepts is novel.-
dc.descriptionFil: Simonetti, Franco Lucio. Fundación Instituto Leloir. Unidad de Bioinformática; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina-
dc.descriptionFil: Teppa, Elin. Fundación Instituto Leloir. Unidad de Bioinformática; Argentina-
dc.descriptionFil: Chernomoretz, Ariel. Fundación Instituto Leloir. Unidad de Bioinformática; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Física de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Física; Argentina-
dc.descriptionFil: Nielsen, Morten. Technical University of Denmark. Center for Biological Sequence Analysis; Dinamarca. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas - Instituto Tecnológico Chascomús. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (sede Chascomús); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Química y Fisicoquímica Biológicas; Argentina-
dc.descriptionFil: Marino Buslje, Cristina . Fundación Instituto Leloir. Unidad de Bioinformática; Argentina-
dc.formatapplication/pdf-
dc.formatapplication/pdf-
dc.languageeng-
dc.publisherOxford University Press-
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/issn/0305-1048-
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/issn/1362-4962-
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://nar.oxfordjournals.org/content/41/W1/W8.long-
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3692073/-
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1093%2Fnar%2Fgkt427-
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess-
dc.rightshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/-
dc.sourcereponame:CONICET Digital (CONICET)-
dc.sourceinstname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas-
dc.sourceinstacron:CONICET-
dc.subjectMutual information-
dc.subjectNetwork-
dc.subjectInformation content-
dc.subjectProtein-
dc.subjectCiencias de la Computación-
dc.subjectCiencias de la Computación e Información-
dc.subjectCIENCIAS NATURALES Y EXACTAS-
dc.titleMISTIC: mutual information server to infer coevolution-
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article-
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion-
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/articulo-
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