Registro completo de metadatos
Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
---|---|---|
dc.provenance | CONICET | - |
dc.creator | Almuzara, Marisa | - |
dc.creator | Montaña, Sabrina Daiana | - |
dc.creator | Lazzaro, Terese | - |
dc.creator | Uong, Sylvia | - |
dc.creator | Parmeciano Di Noto, Gisela Paula | - |
dc.creator | Traglia, German Matias | - |
dc.creator | Bakai, Romina | - |
dc.creator | Centron, Daniela | - |
dc.creator | Iriarte Odini, Andrés | - |
dc.creator | Quiroga, Cecilia | - |
dc.creator | Ramirez, Maria Soledad | - |
dc.date | 2018-06-06T17:57:08Z | - |
dc.date | 2018-06-06T17:57:08Z | - |
dc.date | 2017-12 | - |
dc.date | 2018-06-06T13:46:07Z | - |
dc.date.accessioned | 2019-04-29T15:33:07Z | - |
dc.date.available | 2019-04-29T15:33:07Z | - |
dc.date.issued | 2017-12 | - |
dc.identifier | Almuzara, Marisa; Montaña, Sabrina Daiana; Lazzaro, Terese; Uong, Sylvia; Parmeciano Di Noto, Gisela Paula; et al.; Genetic analysis of a PER-2-producing Shewanella sp. strain harbouring a variety of mobile genetic elements and antibiotic resistance determinants; Elsevier; Journal of Global Antimicrobial Resistance; 11; 12-2017; 81-86 | - |
dc.identifier | 2213-7165 | - |
dc.identifier | http://hdl.handle.net/11336/47514 | - |
dc.identifier | CONICET Digital | - |
dc.identifier | CONICET | - |
dc.identifier.uri | http://rodna.bn.gov.ar:8080/jspui/handle/bnmm/296355 | - |
dc.description | The objective of this study was to investigate the molecular mechanisms explaining the multidrug-resistant (MDR) phenotype found in a novel clinical Shewanella sp. strain (Shew256) recovered from a diabetic patient. Whole-genome shotgun sequencing was performed using Illumina MiSeq-I and Nextera XT DNA library. De novo assembly was performed with SPAdes. RAST Server was used to predict the open-reading frames and the predictions were confirmed using BLAST. Further genomic analysis was carried out using average nucleotide identity (ANI), ACT (Artemis), OrthoMCL, ARG-ANNOT, ISfinder, PHAST, tRNAscan-SE, plasmidSPAdes, PlasmidFinder and MAUVE. PCR and plasmid extraction were also performed. Genomic analysis revealed a total of 456 predicted genes unique to Shew256 compared with other Shewanella genomes. Moreover, the presence of different resistance genes, including blaPER-2, was found. A complex class 1 integron containing the ISCR1 gene, disrupted by two putative transposase genes, was identified. Furthermore, other resistance genes, a transposon containing aph(3′), insertion sequences, phages and non-coding RNAs were also found. In conclusion, evidence of acquisition of resistance genes and mobile elements that could explain the MDR phenotype were observed. This Shewanella sp. represents a prime example of how antibiotic resistance determinants can be acquired by uncommon pathogens. | - |
dc.description | Fil: Almuzara, Marisa. Provincia de Buenos Aires. Ministerio de Salud. Hospital Interzonal de Agudos "Eva Perón"; Argentina | - |
dc.description | Fil: Montaña, Sabrina Daiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina | - |
dc.description | Fil: Lazzaro, Terese. Universidad de la República; Uruguay | - |
dc.description | Fil: Uong, Sylvia. Universidad de la República; Uruguay | - |
dc.description | Fil: Parmeciano Di Noto, Gisela Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina | - |
dc.description | Fil: Traglia, German Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina | - |
dc.description | Fil: Bakai, Romina. Provincia de Buenos Aires. Ministerio de Salud. Hospital Interzonal de Agudos "Eva Perón"; Argentina | - |
dc.description | Fil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina | - |
dc.description | Fil: Iriarte Odini, Andrés. Universidad de la República; Uruguay | - |
dc.description | Fil: Quiroga, Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina | - |
dc.description | Fil: Ramirez, Maria Soledad. Universidad de la República; Uruguay. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina | - |
dc.format | application/pdf | - |
dc.format | application/pdf | - |
dc.format | application/pdf | - |
dc.language | eng | - |
dc.publisher | Elsevier | - |
dc.relation | info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://dx.doi.org/10.1016/j.jgar.2017.06.005 | - |
dc.relation | info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213716517301170 | - |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | - |
dc.rights | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ | - |
dc.source | reponame:CONICET Digital (CONICET) | - |
dc.source | instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas | - |
dc.source | instacron:CONICET | - |
dc.source.uri | http://hdl.handle.net/11336/47514 | - |
dc.subject | SHEWANELLA | - |
dc.subject | DRAFT GENOME | - |
dc.subject | BLA PER-2 | - |
dc.subject | ANTIMICROBIAL RESISTANCE | - |
dc.subject | Otras Ciencias Biológicas | - |
dc.subject | Ciencias Biológicas | - |
dc.subject | CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS | - |
dc.title | Genetic analysis of a PER-2-producing Shewanella sp. strain harbouring a variety of mobile genetic elements and antibiotic resistance determinants | - |
dc.type | info:eu-repo/semantics/article | - |
dc.type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | - |
dc.type | info:ar-repo/semantics/articulo | - |
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