1. RODNA
  2. CONICET
  3. CONICET
Registro completo de metadatos
Campo DC Valor Lengua/Idioma
dc.provenanceCONICET-
dc.creatorRadusky, Leandro Gabriel-
dc.creatorRuiz Carmona, Sergio-
dc.creatorModenutti, Carlos Pablo-
dc.creatorBarril, Xavier-
dc.creatorTurjanski, Adrian-
dc.creatorMarti, Marcelo Adrian-
dc.date2018-08-14T20:05:11Z-
dc.date2018-08-14T20:05:11Z-
dc.date2017-08-
dc.date2018-08-13T18:33:16Z-
dc.date.accessioned2019-04-29T15:44:12Z-
dc.date.available2019-04-29T15:44:12Z-
dc.date.issued2018-08-14T20:05:11Z-
dc.date.issued2018-08-14T20:05:11Z-
dc.date.issued2017-08-
dc.date.issued2018-08-13T18:33:16Z-
dc.identifierRadusky, Leandro Gabriel; Ruiz Carmona, Sergio; Modenutti, Carlos Pablo; Barril, Xavier; Turjanski, Adrian; et al.; LigQ: A Webserver to Select and Prepare Ligands for Virtual Screening; American Chemical Society; Journal of Chemical Information and Modeling; 57; 8; 8-2017; 1741-1746-
dc.identifier1549-9596-
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11336/55495-
dc.identifierCONICET Digital-
dc.identifierCONICET-
dc.identifier.urihttp://rodna.bn.gov.ar:8080/jspui/handle/bnmm/300688-
dc.descriptionVirtual screening is a powerful methodology to search for new small molecule inhibitors against a desired molecular target. Usually, it involves evaluating thousands of compounds (derived from large databases) in order to select a set of potential binders that will be tested in the wet-lab. The number of tested compounds is directly proportional to the cost, and thus, the best possible set of ligands is the one with the highest number of true binders, for the smallest possible compound set size. Therefore, methods that are able to trim down large universal data sets enriching them in potential binders are highly appreciated. Here we present LigQ, a free webserver that is able to (i) determine best structure and ligand binding pocket for a desired protein, (ii) find known binders, as well as potential ligands known to bind to similar protein domains, (iii) most importantly, select a small set of commercial compounds enriched in potential binders, and (iv) prepare them for virtual screening. LigQ was tested with several proteins, showing an impressive capacity to retrieve true ligands from large data sets, achieving enrichment factors of over 10%. LigQ is available at http://ligq.qb.fcen.uba.ar/.-
dc.descriptionFil: Radusky, Leandro Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina-
dc.descriptionFil: Ruiz Carmona, Sergio. Universidad de Barcelona; España-
dc.descriptionFil: Modenutti, Carlos Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina-
dc.descriptionFil: Barril, Xavier. Universidad de Barcelona; España. Catalan Institution for Research and Advanced Studies; España-
dc.descriptionFil: Turjanski, Adrian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina-
dc.descriptionFil: Marti, Marcelo Adrian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina-
dc.formatapplication/pdf-
dc.formatapplication/pdf-
dc.languageeng-
dc.publisherAmerican Chemical Society-
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.7b00241-
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.7b00241-
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/restrictedAccess-
dc.rightshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/-
dc.sourcereponame:CONICET Digital (CONICET)-
dc.sourceinstname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas-
dc.sourceinstacron:CONICET-
dc.source.urihttp://hdl.handle.net/11336/55495-
dc.subjectQUIMIOINFORMATICA-
dc.subjectVIRTUAL SCREENING-
dc.subjectOtras Ciencias Químicas-
dc.subjectCiencias Químicas-
dc.subjectCIENCIAS NATURALES Y EXACTAS-
dc.titleLigQ: A Webserver to Select and Prepare Ligands for Virtual Screening-
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article-
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion-
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/articulo-
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