1. RODNA
  2. FCEN
  3. FCEN - Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. UBA
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Campo DC Valor Lengua/Idioma
dc.provenanceFacultad de Ciencias Exactas y Naturales de la UBA-
dc.contributorEstrin, Darío Ariel-
dc.contributorTrujillo, Madia-
dc.contributorZeida Camacho, Ari F.-
dc.creatorZeida Camacho, Ari F.-
dc.date.accessioned2018-05-04T22:03:36Z-
dc.date.accessioned2018-05-28T16:57:36Z-
dc.date.available2018-05-04T22:03:36Z-
dc.date.available2018-05-28T16:57:36Z-
dc.date.issued2015-12-11-
dc.identifier.urihttp://10.0.0.11:8080/jspui/handle/bnmm/75324-
dc.descriptionLas peroxirredoxinas (Prxs) constituyen una familia de proteínas encargadas de catalizar la reducción de peróxidos, con función antioxidante y de señalización redox, entre otras. Estas enzimas se encuentran ampliamente distribuidas entre los organismos procariotas y eucariotas, y están usualmente presentes en altas concentraciones. Todas ellas comparten el mismo primer paso en su mecanismo catalítico básico, en el cual la cisteína del sitio activo se oxida a ácido sulfénico por sustratos peróxidos tales como peróxido de hidrógeno (H2O2), peroxinitrito, y una gran variedad de hidroperóxidos orgánicos, lo que ocurre con constantes de velocidad varios órdenes de magnitud mayores que para cisteína libre. Particularmente, la alquil hidroperóxido reductasa E (AhpE) de Mycobacterium tuberculosis es una Prx que reacciona más rápido con peroxinitrito que con H2O2 y que presenta una reactividad particularmente alta frente a hidroperóxidos derivados de ácidos grasos. El presente trabajo de tesis aporta información microscópica acerca de los mecanismos de reducción de peróxidos mediada por tioles, tanto en solución acuosa como en el contexto de la reacción catalizada por Prxs. Para tal fin se emplearon una combinación de técnicas de simulaciones computacionales clásicas, cuánticas e híbridas cuántico-clásicas, en combinación con estudios experimentales de cinética rápida de flujo detenido y de equilibrio. En primer lugar se estudiaron las reacciones de oxidación de tioles de bajo peso molecular por H2O2 y peroxinitrito en solución acuosa, determinando los parámetros termodinámicos de activación y describiendo a nivel molecular el proceso reactivo. Posteriormente se investigaron los determinantes moleculares de la capacidad catalítica de Prxs, utilizando como modelo de trabajo la MtAhpE. En último lugar se analizó la especificidad por el sustrato oxidante para el caso particular de la MtAhpE, comparando la interacción y reactividad con H2O2 y diferentes hidroperóxidos orgánicos.-
dc.descriptionPeroxiredoxins (Prxs) constitute a protein family that catalyzes the reduction of peroxides, with antioxidant and redox signaling functions, among others. These enzymes are ubiquitous and widely distributed in prokaryote and eukaryote organisms, and are usually found at high concentrations. They all share the same first step of their basic catalytic mechanism; the cysteine residue in the active-site gets oxidized by peroxides such as hydrogen peroxide (H2O2), peroxynitrite and a variety of organic hydroperoxides, which occurs several orders of magnitude faster than in the case of free cysteine. In particular, alkyl hydroperoxide reductase (AhpE) from Mycobacterium tuberculosis is a Prx that reacts faster with peroxynitrite than with H2O2 and shows a particularly high reactivity versus fatty acid derived hydroperoxides. The present thesis work is focused in providing molecular insights about peroxide reduction mechanisms by thiols, both in aqueous solution and in the context of the catalyzed reaction by Prxs. For this purpose, a combination of classical, quantum and hybrid quantum-classical simulations, together with fast stopped-flow kinetics and equilibrium experiments was performed. First, we studied the reactions of low molecular weight thiols with H2O2 and peroxynitrite in aqueous solution, determining the thermodynamic activation parameters and describing the reactive process at the molecular level. Afterwards, we investigated the molecular basis of Prxs catalytic ability, using MtAhpE as a model. Finally, the substrate specificity of MtAhpE was analyzed via the comparison of the interaction and reactivity with H2O2 and different organic hydroperoxides.-
dc.descriptionFil:Zeida Camacho, Ari F.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.-
dc.formatapplication/pdf-
dc.languagespa-
dc.publisherFacultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires-
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess-
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar-
dc.source.urihttp://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_5877_ZeidaCamacho-
dc.subjectTHIOLS-
dc.subjectPEROXIDES-
dc.subjectCYSTEINE-
dc.subjectPEROXIREDOXINS-
dc.subjectMOLECULAR DYNAMICS-
dc.subjectQM/MM-
dc.subjectTRANSITION STATE-
dc.subjectACTIVATION PARAMETERS-
dc.subjectSTOPPED-FLOW KINETICS-
dc.subjectTIOLES-
dc.subjectPEROXIDOS-
dc.subjectCISTEINA-
dc.subjectPEROXIRREDOXINAS-
dc.subjectDINAMICA MOLECULAR-
dc.subjectQM/MM-
dc.subjectESTADO DE TRANSICION-
dc.subjectPARAMETROS DE ACTIVACION-
dc.subjectCINETICA A FLUJO DETENIDO-
dc.titleEstructura y mecanismo de acción de peroxirredoxinas: estudio teórico y experimental-
dc.titleStructure and reaction mechanism of peroxiredoxins: a theoretical and experimental study-
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis-
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/tesis doctoral-
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion-
Aparece en las colecciones: FCEN - Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. UBA

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